Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5BQ9UGL1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5BQ9UGL1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms