Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNAL1Q9UBT7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNAL1Q9UBT7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms