Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms