Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PHRF1Q9P1Y6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHRF1Q9P1Y6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHRF1Q9P1Y6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms