Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMG20BQ9P0W2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms