Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXXC1Q9P0U4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXXC1Q9P0U4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms