Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EHD3Q9NZN3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms