Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms