Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA3Q9NZ52 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms