Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms