Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAPOLBQ9NRJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms