Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR1BQ9H9Y6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR1BQ9H9Y6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms