Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BCAS3Q9H6U6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAS3Q9H6U6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms