Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDT1Q9H211 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDT1Q9H211 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms