Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMX4Q9H1E5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMX4Q9H1E5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMX4Q9H1E5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms