Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM49AQ9H0Q0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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