Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP44Q9H0E7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP44Q9H0E7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP44Q9H0E7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms