Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80BQ9C086 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80BQ9C086 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms