Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXQ1Q9C009 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXQ1Q9C009 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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