Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRD1Q9BXT4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD1Q9BXT4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms