Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP5Q9BXF6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP5Q9BXF6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms