Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYCP2Q9BX26 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYCP2Q9BX26 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms