Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM62Q9BVG3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM62Q9BVG3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms