Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms