Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAAF1Q9BRP4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAAF1Q9BRP4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms