Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTP3Q9BQQ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTP3Q9BQQ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms