Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN18Q99952 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN18Q99952 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms