Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPAS2Q99743 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPAS2Q99743 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPAS2Q99743 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS2Q99743 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms