Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms