Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM20AQ96MK3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms