Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCMTD1Q96MG8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMTD1Q96MG8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms