Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRRC1Q96M27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms