Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00615Q96LM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms