Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LCORQ96JN0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCORQ96JN0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms