Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHDQ96IW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms