Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM46AQ96IP4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM46AQ96IP4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms