Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CENPNQ96H22 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPNQ96H22 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms