Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT2BQ96GJ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT2BQ96GJ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT2BQ96GJ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT2BQ96GJ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT2BQ96GJ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT2BQ96GJ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT2BQ96GJ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms