Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC10A4Q96EP9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC10A4Q96EP9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms