Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OPTNQ96CV9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OPTNQ96CV9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OPTNQ96CV9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms