Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C8orf44Q96CB5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf44Q96CB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms