Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSPC1Q8WXF1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSPC1Q8WXF1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms