Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCG3Q8WXD2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms