Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC12Q8WVT3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms