Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMBR1Q8WVP7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms