Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STAG1Q8WVM7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms