Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX29Q8TEQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX29Q8TEQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms