Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DDX54Q8TDD1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX54Q8TDD1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms