Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Agr3Q8R3W7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Agr3Q8R3W7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms