Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNERQ8NFT8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DNERQ8NFT8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNERQ8NFT8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms